أصدر الرئيس السوداني توجيهات هامة للقادة العسكريين والأمنيين تخص التصويت الخاص في انتخابات مجالس المحافظات وذكر الناطق باسم القائد العام للقوات المسلحة يحيى رسول أنه حفاظاً على سلامة العملية الانتخابية وإبعاداً لها عن أية تأثيرات سلبية وجه السوداني جميع القادة العسكريين والأمنيين وقادة ومديري الأجهزة الأمنية وآمري التشكيلات الأمنية والعسكرية بالعمل والالتزام بتأمين الخيارات الحرة للمنتسبين والمقاتلين في التصويت الخاص وعدم التدخل بأي شكل من الأشكال في خياراتهم الانتخابية.

كما وجه السوداني بمنع أية إشارة أو تلويح يفهم منه المنتسبون والمقاتلون بأنها إملاءات انتخابية حيث شدد على اتخاذ أعلى حالات الضبط والمتابعة إزاء أية حالة تدخل في الاختيارات الانتخابية أو ربط بين جهة الصوت الانتخابي للمنتسب.

كما أضاف بالتشديد على أهمية الصوت الانتخابي الحر للمنتسبين والمقاتلين بوصفهم مواطنين يحمي الدستور والقوانين حرية اختياراتهم السياسية مثلما تقدم لهم الحماية بوجه أية ضغوط أو محاولات للتأثير بخلاف رغبتهم واختياراتهم.